COVID-19 ir koronavīrusa SARS-CoV-2 izraisīta infekcijas slimība, kuras pandēmija pašlaik nopietni apdraud daudzu cilvēku dzīvību un veselību gan Latvijā, gan pasaulē.
Latvijas nacionālās biobankas – Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes ietvaros ir izveidota Latvijā saslimušo COVID-19 pacientu un šo slimību pārslimojušo iedzīvotāju bioloģisko materiālu un datu pētniecības kopa jeb kohorta. Pašlaik šajā kohortā iekļauti jau vairāk kā 500 COVID-19 gadījumi ar paplašinātu klīnisko raksturojumu un molekulārajiem datiem, kas iegūti bioloģisko paraugu izpētē. Šī paraugkopa tiek izmantota, lai veiktu vīrusa izplatības monitorēšanu un ierobežošanu Latvijā, veiktu SARS-CoV-2 vīrusa un COVID-19 izpēti, sekmētu individualizētu terapiju izstrādi un uzlabotu ārstēšanu.
COVID-19 kohortā iekļautie bioloģiskie paraugi:
- Asins atvasinātie bioloģiskie materiāli (plazma, serums, DNS, RNS, perifērās mononukleārās asins šūnas);
- Vīrusa iztriepes no kakla (RNS, DNS)
- Fēces (DNS, RNS);
- Urīns;
Molekulārie dati, kas pieejami pētniecībai:
- Genotipi (Infinium Global Screening Array)
- Citokīnu līmeņi asins plazmā (Luminex)
- Metabolīti asins serumā (Orbitrap)
- Asins šūnu RNA-Seq (MGI platforma)
- SARS-CoV-2 genoma sekvenēšana (MGI/Illuminas platformas)
- Fēču metagenoma sekvenēšana (shot-gun sekvenēšana, MGI platforma)
- SARS-CoV-2 noteikšana fēcēs (RT-QPCR)
- Mutes metagenoma sekvenēšana (16S rRNS sekvenēšana, Illuminas platforma)
- Bioķīmiskie parametri asinīs
Lai sazinātos par sadarbību un uzzinātu sīkāku informāciju par paraugu un/vai datu pēntiecību, lūdzu, rakstiet vigdb@biomed.lu.lv
Finasējums:
COVID-19 pacientu bioloģiskā materiālu biobanka un saistīto datu kolekcija izveidota, īstenojot Valsts pētījumu programmu COVID-19 seku mazināšanā Latvijā (VPP-COVID-2020/1-0016), savukārt SARS-CoV-2 vīrusa genoma sekvencēšana veikta īstenojot ERAF projektu Nr. 1.1.1.5/17/I/002 “Pētījuma par SARS-CoV-2 vīrusa epidemioloģiju un filoģenēzi Latvijā”.
